Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE4AQ14139 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4AQ14139 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms