Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CIRBPQ14011 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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