Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
APOFQ13790 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOFQ13790 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOFQ13790 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOFQ13790 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOFQ13790 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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