Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CUL3Q13618 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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CUL3Q13618 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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CUL3Q13618 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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CUL3Q13618 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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CUL3Q13618 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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CUL3Q13618 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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CUL3Q13618 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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CUL3Q13618 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CUL3Q13618 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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