Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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PEX6Q13608 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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PEX6Q13608 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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PEX6Q13608 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PEX6Q13608 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
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