Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PTK7Q13308 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PTK7Q13308 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms