Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SRSF6Q13247 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SRSF6Q13247 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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