Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CBX3Q13185 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CBX3Q13185 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms