Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CALCOCO2Q13137 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CALCOCO2Q13137 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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