Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NR1H3Q13133 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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NR1H3Q13133 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NR1H3Q13133 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms