Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NPRL3Q12980 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NPRL3Q12980 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms