Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD47Q08722 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD47Q08722 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD47Q08722 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD47Q08722 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD47Q08722 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD47Q08722 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD47Q08722 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD47Q08722 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD47Q08722 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CD47Q08722 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms