Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABPAQ06546 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABPAQ06546 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms