Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
IRF8Q02556 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
IRF8Q02556 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms