Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDR2Q01850 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDR2Q01850 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms