Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CD83Q01151 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CD83Q01151 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CD83Q01151 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms