Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTA1P68133 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms