Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS28P62857 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS28P62857 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
RPS28P62857 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPS28P62857 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS28P62857 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS28P62857 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS28P62857 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS28P62857 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS28P62857 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS28P62857 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPS28P62857 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1153.3 ms