Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ARF6P62330 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ARF6P62330 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF6P62330 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF6P62330 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ARF6P62330 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms