Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVK-21P61565 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVK-21P61565 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms