Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFRD-1P60508 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms