Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FAM3BP58499 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FAM3BP58499 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms