Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB25P57735 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RAB25P57735 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RAB25P57735 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB25P57735 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB25P57735 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB25P57735 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB25P57735 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RAB25P57735 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms