Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PAX9P55771 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PAX9P55771 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms