Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCAMP50895 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCAMP50895 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCAMP50895 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCAMP50895 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCAMP50895 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCAMP50895 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
BCAMP50895 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCAMP50895 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCAMP50895 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCAMP50895 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCAMP50895 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms