Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RBP2P50120 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RBP2P50120 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RBP2P50120 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBP2P50120 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBP2P50120 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBP2P50120 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBP2P50120 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RBP2P50120 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms