Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GSK3BP49841 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GSK3BP49841 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms