Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POU3F4P49335 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms