Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTDSS1P48651 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTDSS1P48651 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms