Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CRATP43155 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CRATP43155 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CRATP43155 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CRATP43155 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms