Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGFBR1P36897 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TGFBR1P36897 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms