Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPB2P35606 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPB2P35606 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPB2P35606 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPB2P35606 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPB2P35606 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPB2P35606 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPB2P35606 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPB2P35606 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPB2P35606 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPB2P35606 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPB2P35606 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPB2P35606 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COPB2P35606 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COPB2P35606 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPB2P35606 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPB2P35606 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms