Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HTR2AP28223 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms