Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDE4AP27815 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms