Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHMLP26374 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHMLP26374 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHMLP26374 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHMLP26374 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms