Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTX3P26022 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTX3P26022 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTX3P26022 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms