Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAMP1P23763 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAMP1P23763 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms