Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CD53P19397 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CD53P19397 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CD53P19397 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CD53P19397 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms