Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHCEP18577 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHCEP18577 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHCEP18577 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHCEP18577 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHCEP18577 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHCEP18577 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHCEP18577 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHCEP18577 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHCEP18577 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHCEP18577 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHCEP18577 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHCEP18577 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHCEP18577 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHCEP18577 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHCEP18577 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHCEP18577 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RHCEP18577 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms