Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DESP17661 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DESP17661 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DESP17661 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DESP17661 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DESP17661 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DESP17661 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DESP17661 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms