Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD46P15529 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD46P15529 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD46P15529 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD46P15529 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD46P15529 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD46P15529 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD46P15529 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD46P15529 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD46P15529 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CD46P15529 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CD46P15529 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CD46P15529 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD46P15529 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD46P15529 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD46P15529 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD46P15529 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD46P15529 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CD46P15529 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms