Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ITGA4P13612 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms