Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf88P0DMB2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms