Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RD3LP0DJH9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms