Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PARP1P09874 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP1P09874 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP1P09874 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP1P09874 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP1P09874 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP1P09874 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PARP1P09874 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PARP1P09874 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PARP1P09874 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms