Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRCP08575 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRCP08575 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
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