Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NGFRP08138 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NGFRP08138 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NGFRP08138 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NGFRP08138 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NGFRP08138 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms