Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3DP05423 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR3DP05423 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms