Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZBED1O96006 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZBED1O96006 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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