Protein–RNA interactions for Protein: O43916

CHST1, Carbohydrate sulfotransferase 1, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST1O43916 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHST1O43916 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHST1O43916 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHST1O43916 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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